"Un destino sacudido, en un mundo loco--- Una llama de vida ardiendo en un mundo moribundo... Y ahora, un futuro más que se teje--- Este es el final alternativo que no se ha podido contar antes: Una muy grande, una muy pequeña, una muy preciosa... Cuento de amor y coraje." Muv-Luv Alternative continúa la historia de Shirogane Takeru después de los eventos del Muv-Luv original. Esta es la historia de un amor tan profundo que rompe todas las barreras; sobre la valentía ante la adversidad y la superación de las dificultades. Takeru se enfrenta a obstáculos insuperables mientras todo su mundo se pone patas arriba a su alrededor.