Después de derrotar a Shub-Niggurath, regresas a tu base de operaciones en la Tierra, pero no todo es cielos azules y mariposas. Aparentemente, no todas las fuerzas del TERREMOTO han sido sometidas. El caos sobreviene a medida que te abres camino a través de los minions de QUAKE y hacia la entrada infestada. Tu única opción es encontrar la fuente del mal y acabar con él. Sin dudarlo y con más agallas que sentido común, saltas a un portal de destino desconocido.